《史上最强弟子兼一 黑暗袭击》讲述白滨兼一是个善良的高中一年级生，但总受到许多不合理的欺负。在偶然的情况下，他与转学生风林寺美羽成了好朋友。之后受到美羽的吸引之下，兼一到了名为梁山泊的道场修行武术。经过一连串非人道的修行，兼一的武术造诣上升非凡，却也因此被不良组织诸神黄昏盯上，被逼迫要与诸神黄昏所派遣的刺客武术家决斗，在瓦解了诸神黄昏之后。黑暗为了要和梁山泊争夺史上最强这个称号，兼一又必须和黑暗的弟子群YOMI进行决斗。